O Reino Unido deu um salto em frente nos seus esforços para usar genômica patogênica para melhorar a segurança da saúde. Hoje, a Agência de Segurança da Saúde do Reino Unido (UKHSA) lança uma iniciativa mundial de metagenómica para ajudar na detecção rápida de doenças infecciosas que poderiam ameaçar o Reino Unido. O Programa de Colaboração e Análise de Vigilância Metagenomônica (mSCAPE), que tem estado em desenvolvimento durante o último ano, está pilotando o uso de dados metagenómicos para vigilância de saúde pública e análise de patógenos. O programa é uma iniciativa colaborativa, liderada pelo UKHSA e envolvendo um consórcio de NHS e parceiros acadêmicos, incluindo a Universidade de Birmingham, a Universidade de Edimburgo, e a NHS Clínica Metagenomics Network liderada por Guyňs e St Thomasň NHS Foundation Trust.

O UKHSA irá tirar dados de patógenos anônimos de vários laboratórios que estão usando metagenômica para o diagnóstico, incluindo aqueles do NHS, e analisá- los a nível nacional para monitorar tendências, epidemiologia e emergência de patógenos a velocidade. Isto permitirá avaliar a capacidade de melhorar significativamente a identificação de novos surtos, bem como permitir que a fonte de um surto seja melhor compreendida, previsões a serem feitas sobre a eficácia dos tratamentos potenciais, e quaisquer mutações relacionadas podem ser identificadas. O uso eficaz de dados metagenômicos irá adicionar uma nova e crucial visão aos sistemas de vigilância da proteção da saúde atuais no Reino Unido. o mSCAPE pretende desenvolver a capacidade de usar estes dados como parte da vigilância contínua do UKHSA de infecções novas e emergentes, patógenos de potencial pandêmico, e monitorar a evolução de patógenos que causam doenças.

A metodologia metagenómica permite sequenciar não direcionadamente amostras de pacientes para a presença de vírus patogênicos e bactérias, o que é um passo em frente significativo nas habilidades de detecção e diagnóstico. Metodologias genômicas tradicionais têm exigido que os cientistas alvom sequenciamento de amostras para patógenos que já são conhecidos pela comunidade científica e médica. Os métodos metagenômicos patognósticos não exigem que os cientistas saibam com certeza quais patógenos estão presentes numa amostra antes da realização do sequenciamento. Esta é uma grande vantagem na detecção de patógenos conhecidos, mas inesperados, para os quais não estão disponíveis testes específicos e para patógenos normalmente não encontrados em humanos. Também é benéfico no caso de surgimento de um patógeno desconhecido anteriormente. O sequenciamento metagenômico está se tornando um teste de diagnóstico clínico, e seu uso está sendo atualmente expandido no NHS.

A professora Susan Hopkins, conselheiro médica-chefe da UKHSA, disse. A genômica tem sido um aspecto crucial da resposta ao COVID- 19 pandemia desde o início, e a enorme experiência técnica do Reino Unido nesta área nos permitiu desempenhar um papel de liderança na identificação e análise da COVID- 19 variantes à medida que emergem. O novo programa mSCAPE nos permitirá usar a capacidade de genômica líder do Reino Unido para realizar vigilância comunitária usando dados de sequenciamento patognóstico pela primeira vez em qualquer lugar do mundo, e nossa nova iniciativa para compartilhar nossos dados genômicos patogênicos demonstra nosso compromisso com nossos dados sendo usados para melhorar a saúde globalmente.

Este é um desenvolvimento muito emocionante que irá aumentar a nossa capacidade de responder rapidamente a novos patógenos emergentes e ajudará a garantir que estamos preparados o mais possível para agir de forma rápida e eficaz para proteger o público de ameaças futuras. Professora Dame Sue Hill, Chefe de Ciências do NHS England e Responsável Sênior da Genomics do NHS, disse:.

A genômica está revolucionando a forma como previmos, prevenimos, diagnosticamos e tratamos doenças – seja diagnosticando condições raras em crianças mais rapidamente, ajudando a personalizar tratamentos contra o câncer para torná- las mais eficazes, ou identificando pessoas com maior risco de doença renal.

O programa mSCAPE é outro grande exemplo de como o Reino Unido está liderando o mundo neste campo, e estamos satisfeitos por poder apoiá-lo através de nossas Rede de Excelência em Infecções Respiratórias Severas.